Setelah gantung sepatu, Aji Santoso beralih profesi menjadi pelatih sepak bola. Sebagai Pelatih, dia terakhir membawa PON Jatim meraih emas pada pagelaran PON Kaltim 2008, dan meraih perunggu pada ajang POM ASEAN di Kuala Lumpur, Malaysia.
Aji pernah bermain untuk Argo Manunggal Sawunggaling (AMS) Kepanjen pada 1986-1987, Gajayana Malang (1987), Persema Jr pada 1987, Arema Malang (1988-1995), Persebaya Surabaya (1995-1999) dan Timnas Indonesia pada tahun 1990-2000.
Karier kepelatihan
- SSB Arema
- Akademi Arema (2004)
- Timnas U-17 (2005)
- Persiko Kota Baru (2006)
- POMNAS Jatim (2007)
- Persekam Metro Kab Malang (2007)
- PON Jatim (2006/2008)
- POM ASEAN (2008)
- Persik Kediri (2009)
- Persebaya Surabaya (2009)
- Persisam Putra Samarinda (2009-2010)
- Persema Malang (2010)
- Persebaya Surabaya (2010-2011)
- Timnas U-23 Asisten Pelatih (2011)
- Timnas U-23 (2013-2015)
- Arema FC (2017)
- Persela Lamongan (2017)
- PSIM Jogja (2019)
- Persebaya Surabaya (2019)
- Persikabo 1973 (2023-sekarang)
- PSPS Riau (2024 - )
Baca Juga:Sosok Calon Pelatih PSPS Riau, Nama Aji Santoso Mencuat
